碱性磷酸酶，英文全称是Alkaline phosphatase，英文简称是ALP。γ-谷氨酰转肽酶，英文全称是γ-glutamyl transpeptidase，英文简称是γ-GT或GGT。
在肝功能检查中碱性磷酸酶是反映胆汁淤积的指标，升高提示可能存在肝胆系统疾病。胆汁淤积分为肝内胆汁淤积和肝外胆汁淤积。肝内胆汁淤积是肝细胞形成、分泌胆汁或微小胆管排泄胆汁的能力受到损伤，肝外胆汁淤积指的是大的胆管病变导致胆汁流出受阻。如果把胆汁形成和排泄的系统比做一棵大树，树叶是肝细胞，叶柄是小胆管，叶柄连接着树枝，树枝是各级胆管系统，树干是胆总管。肝内胆汁淤积相当于树叶和叶柄出了问题，这种情况下病变部位比较细微，需要病理活检才能看到病变，而超声等影像学检查往往无法看到导致胆汁淤积的异常改变。肝外胆汁淤积相当于树枝和树干出了问题，这种情况下可以通过超声/CT/核磁间接地看到胆道狭窄、扩张、占位等改变。
可以导致肝内胆汁淤积的疾病包括原发性胆汁性胆管炎（PBC），原发性硬化性胆管炎（PSC），急性病毒性肝炎胆汁淤积期等，此外饮酒和药物也可以导致肝内胆汁淤积。可以导致肝外胆汁淤积的疾病包括胆石症，胆道恶性肿瘤，继发性硬化性胆管炎（SSC）等。此外一些浸润性的肝病也可以导致碱性磷酸酶升高，比如原发性肝癌，肝转移瘤，结核，结节病或淀粉样变性等。
除了肝胆系统疾病，其他一些病理或生理情况也会导致碱性磷酸酶升高，比如骨骼疾病，某些肝外肿瘤，青少年生长发育期，妊娠晚期，某些人高脂饮食后，年龄增长等。
所以，如果发现肝功能检查中碱性磷酸酶升高，首先要判断碱性磷酸酶是否来源于肝胆系统。这时最简单的方法就是看肝功能检查中的γ-谷氨酰转肽酶是否也升高，如果γ-谷氨酰转肽酶也同步升高提示碱性磷酸酶是肝胆来源的，需要对肝胆系统进行检查以查找病因。如果γ-谷氨酰转肽酶不升高，提示碱性磷酸酶可能不是来源于肝胆疾病，需要考虑肝胆以外的其他情况，当然一些特殊的胆汁淤积性肝病γ-谷氨酰转肽酶可以不升高，但是很少见。确定碱性磷酸酶是否来源于肝胆系统也可以查一些特殊指标，比如血清碱性磷酸酶肝脏特异性的同工酶或血清5’-核苷酸酶（5’-NT），但是这两个指标不是常规检测指标，临床上没有广泛应用。
此外，γ-谷氨酰转肽酶升高的原因众多，除了肝胆系统疾病，其他很多情况也可以引起这个指标升高，比如糖尿病，胰腺疾病，心肌梗死，肺病，肾病等等，甚至饮酒或服用某些药物也可以导致这个指标升高，比如苯妥英钠，苯巴比妥，卡马西平以及华法林等。所以γ-谷氨酰转肽酶这个指标特异性很差，没有指向性，升高并不代表一定是肝胆的问题。
因此肝功能化验中碱性磷酸酶和γ-谷氨酰转肽酶应该放在一块看，两者同时升高提示存在胆汁淤积，单一指标的升高还不足以判断。一般认为如果碱性磷酸酶大于正常参考值上限的1.5倍并且γ-谷氨酰转肽酶大于正常参考值上限的3倍的情况下具有临床意义，说明结果是有问题的，需要进一步的检查来查找胆汁淤积的病因。
胆汁主要是由肝细胞生成，然后进入胆道系统经过十二指肠乳头排入十二指肠，帮助消化食物。胆囊具有储存胆汁的作用，在进食后，尤其是进食油腻食物后，胆嚢会收缩，随后大量胆汁排入十二指肠。当肝细胞生成、分泌胆汁或者是胆道系统排出胆汁的功能发生障碍时，就会导致胆汁排不出去，淤积在肝内，甚至进入血液循环系统，进而导致肝脏受损，出现相应的症状。胆汁淤积的主要症状是乏力，瘙痒，严重时也可以出现黄疸。
如果怀疑存在胆汁淤积，可以做超声检查，如果超声发现胆管异常则考虑肝外胆汁淤积，可以进一步查查CT/超声内镜/核磁（比如MRCP）/ERCP等检查协助确认病因。如果超声检查不足以除外肝外胆汁淤积，也需要进一步查其他影像学检查。超声检查也有助于发现肝内占位性病变。如果怀疑肝内胆汁淤积，应回顾患者的饮酒史以及近6周内所有药物的服药史，包括中药，营养品，膳食补充剂等等，因为很多药物可以导致胆汁淤积，是胆汁淤积常见的原因。如果怀疑药物导致的胆汁淤积，可以停用可疑药物后复查肝功能。另外，需要排查原发性胆汁性胆管炎（PBC），这是一种自身免疫性疾病，是胆汁淤积比较常见的原因，可以查抗核抗体（ANA），抗线粒体抗体（AMA）和抗线粒体抗体M2亚型（AMA-M2）。如果仍然找不到胆汁淤积的原因，可以考虑行肝穿刺活检，针对一些遗传代谢性疾病可以考虑做基因检测。